九寨沟的宗教是以苯教为基础，佛教文化为主导的藏传佛教。苯教，是古代藏区存在的、以崇拜自然对象为主的原始宗教形式，这种崇拜传统一直在民间流传。苯教是一种多神崇拜，崇拜的对象包括日、月，星辰、山川、河流、湖泊、飞禽走兽等，相信“万物有灵”。苯教“万物有灵”的多神论思想有广泛的群众基础和社会基础，同时，佛教”人生唯苦，四大皆空，生死轮回，因果报应“等缘起的思想理论以寺院为主在九寨沟藏传佛教文化中起着主导作用。
转经
转经，按苯教“雍仲”的旋转方向，向右转。转经是普及面最广的一种特别礼仪。转经筒内装有一定数量的经咒，每转动一下经轮就等于念诵了数百遍经轮内的经咒，其无量的功德就在于此。因此，“转经”在藏族社会久兴不衰。
佛神山与神山
佛神山与神山，如九寨沟的扎伊扎嘎山，是藏传佛教的象征，藏族人称之为“尼”。佛神山是藏传佛教教徒信仰佛教的活动场所，通过转山磕长头，诵经虔诚，祈祷达到自己清心净身的目的。
嘛尼堆
嘛尼堆
嘛尼堆，九寨沟藏区称为“牙则”。是堆积在神山的山顶或转山必经的山口和各藏寨神山指定的位置上的有经文的石堆或神箭(木制的各种兵器)，堆上还插有经幡。“牙则”起源于苯教万物有灵，属于原始宗教的大自然崇拜，是藏传佛教中崇拜祭祀山神的主要仪式，是原始苯教山神崇拜的具体体现。“牙则”的位置由活佛或高僧选定。“牙则”分为地上和地下两种。地上的堆放石头，这些石头，有的是信徒经过千难万苦从其他佛山圣地带来的;有的是本地经过念经护法的;有的是转山人放上的。九寨沟多数“牙则”是各种木制的兵器，是每次念经祭祀山神时由各户做的。第二种是埋在地下的，叫“布得”，主体用金属罐或陶瓷瓶，中间竖一段用方枝柏树心做的方木，称为“命木”。上面缠绕八字真经，周围装上五谷、金银、珠宝、宝瓶、各种兵器等物 ，深埋后在上面栽上树木花草等堆成“牙则”。
经幡
经幡
九寨沟藏民称为“葛达”，意为插在门口的旌旗，实是密宗文化与中原文化相结合的产物。经幡根据其用途和不同的内容长短不一，短的几米，长的树十米，分蓝、白、红、绿、黄五种颜色，在长经幡的边上还有各种颜色的小装饰片，上面印有“龙达”。九寨沟的经幡多用木条做成旗杆，且高大，多为竖插，横挂的较少，这是九寨沟经幡的特点。
节日盛会
麻孜会
农历正月为藏族的年节。而九寨沟最隆重的节日当数农历三月十五的“麻孜会”。这天男女老少都身着盛装去扎如寺参加庙会， 烧香敬神，朝佛转山，向师长亲友、和尚喇嘛敬献哈达，表达美好的祝愿。庙会上也有唱歌跳舞、演藏戏等庆典活动。青年男女也常在这天寻觅知音，交结朋友。
德朵节
每年冬季至初春，是易发生火灾的时节，就以村寨为单位，请喇嘛在专门的院内念经祈求免灾。这一节日由两个仪式组成：一是守火仪式，一是驱火仪式。守火仪式时，要在寨子中最适宜观望的地方搭一个了望蓬，每家委派一名代表驻守望蓬。在晚上十二点前，寨民围寨转游，边转边唱，告戒人们防火。驱火仪式由几个寨子联合举办，持续一天。寨民均穿漂亮的新衣，念经祷告，观看由数十人组成的马队摇旗呐喊，鸣枪驱火。
转山节
农历六月十五和七月十五的转山节，主要活动是朝拜扎依扎嘎神山，但也充满节日的喜庆气氛。转山这天，藏胞大都要着盛装，相互祝酒，齐声歌唱，骑马或步行绕神山一圈。
“良敏王清”庙会每年正月初五，为纪念苯教有名喇嘛人圆寂升天，藏民们聚会于扎如寺转经。
